“中心”实行学校直属管理，实验教学中心实行主任负责制，三大实验平台和校内实训基地均实行实验室主任具体负责制，贵重仪器由专人负责保管，实验耗材特别是有毒物品使用审批制度等。

“中心”在执行课程实验教学任务计划时与教务处协调沟通，在规划实验室建设时与实践教学设备处进行协调沟通。学校对中心主任进行考核，“中心”成立实验教学督导组，聘请教学经验丰富的教授为督导组成员，负责对实验教学进行监督和指导。

中心制订了开放实验平台的管理细则、实施程序、工作流程和考评办法。有力促进了中心教师和在校学生参与创新实验实践的积极性，提高了教师实验技术水平和学生的创新和动手能力。